В то время каждый второй мульт мутил или что то про объединение в большого чувака, или были группами из n-чуваков...

То, что, как мне кажется, может быть тем, что вы ищете, но уверенности никакой:
Непобедимая команда супер-обезьянок (Больше трёх, строятся на теме духов и самопознания, возможно были и самураи)
A.T.O.M. (Что то про группу человеков на супермашинах, которые собираются воедино)
ПРИКЛЮЧЕНИЯ ГАЛАКТИЧЕСКОЙ КОМАНДЫ (Людей трое, управляли космокораблём)

Самое очевидное же:
Шаман Кинг, в нём есть всё, кто объединения трёх в одного.

Но самое вероятное это даже не Шаман Кинг... А парамнезия, от которой воспоминания о двух мультах "слиплись" в голове.

нет точно не шаман кинг, там если я правильно помню трое в одного не сливались

По описанию Шаман кинг / Shaman King подходит